制定个体心理咨询方案分为两个步骤，一是商定咨询的目标，二是商定咨询方案。
在商定咨询目标之前，需要先全面深入地了解求助者，在对来访者完成了心理诊断的基础之上才能进行。了解来访者，可以从六个“w”和一个“h”着手（在诊断的时候收集的是来访者的基本信息如家庭状况等，而在确定咨询目标前是收集关于问题的资料）：
“who”，来访者是谁，他是什么样的性格，其行为模式、认知特点和情绪变化又是如何的。
“what”，发生了什么事情，要了解事情发生的具体细节。
“when”，何时发生的，了解事情发生的具体时长，这样的事情以前是否发生过，次数是多少等。
“where”，事情在哪里发生的，是在什么样的环境下发生的。
“why”，事情发生的原因是什么，直接原因是什么，根本原因是什么。
“which”，这件事的发生和什么人有关，与之有关的人和来访者又是些什么关系。
“how”，事情是如何演变的，事情发生至今，又有了什么样的变化。
在于不同的来访者交谈时，要注意针对不同的对象，不同的心理问题采取不同的方式：
对于年龄特征不一样的来访者，儿童适用于边玩边谈，青少年最好要与之建立平等的关系，老年人则要尊重他们并将交流中心放在现在和过去（由于老年人个性已经稳定，所以不要试图去改变他们的个性）。
对于性格特征、文体特征和文化特征不一样的来访者，也都需要咨询师掌握适当的技巧。
在收集了充分的资料之后，要商讨双方的共同目标，且是咨询师和来访者一起商定。咨询的目标应具备以下特征：
一、属于心理学的性质，如果超出心理学的范围，往往也不属于心理咨询的范围。
二、积极的，一般老说，面对问题、解决问题是积极的，而回避问题则往往是消极的。
三、具体或量化的，咨询目标要确定、量化，否则咨询双方难以执行也难以咨询效果进行评估。
四、可行的，咨询目标要商定在可行的范围内，不要让咨询目标超出来访者的可能达到水平。
五、可以评估的，应至少有一种评估手段或手法可以对目标的进展情况进行评估。
六、双方可接受的，咨询目标是双方要实现的目标，应该是由双方共同商定的。
七、多层次统一的，咨询的目标应该是具体目标和终极目标（要达到人格健全和心理健康的水平）相统一的，近期目标与远期目标是统一的。
以上是关于咨询目标的要求，在具体的商定目标过程中，咨询师还需要与来访者共同进行。首先，要找出来访者最主要的问题，当来访者急于解决的问题很多时，就根据轻重缓急来确定咨询目标，咨询师可以询问：“你认为这些问题中，哪一个对你的影响最大？你最想解决哪个问题？”如果在商定目标中出现来访者和咨询师的目标不一致（很多时候来访者只希望解决一个表面的问题，而咨询师却从更深入的角度来思考问题），这时要以来访者的目标为主。
其次，是咨询目标需要确定一个大目标，这个大目标是促进来访者的心理健康和发展，充分实现人的潜能，达到人格完善，最终拥有健康、快乐的生活，在这样的终极目标的统领下，确立具体目标。
有些时候，来访者不能够提供有效的咨询目标，这通常有两种情况：一是来访者不清楚自己的问题是什么，只是觉得心里难受，这时，咨询师需要用开放性的问题来帮助来访者探索问题，通过澄清、具体化等方式来确定咨询目标。第二种情况，来访者确定的目标只是最为表面的，未涉及根源性问题，这时，咨询师需要引导来访者探索深层的问题。
在确立目标的过程中，咨询师可能会出现一些关于咨询目标的错误认知：咨询要完全保持价值中立、咨询应该给来访者灌输正确的思想（价值内容干预）、将来访者的快乐体验作为目标、把来访者适应环境作为目标。在咨询中，咨询师也是人，不可能完全抛却自己的价值观，并且全然中立就意味着不去干预，和咨询的终极目标（希望来访者健康、人格健全等观念）相矛盾。当然，不能割裂个人价值观，也不能将咨询师自身的价值观强加到来访者的身上，如果欲将自己认为正确的思想替代来访者原来的信念，那么这就变成了思想教育的内容了，不符合心理咨询的规范。将来访者获得快乐体验作为咨询目标也是不恰当的，因为成长总是在痛苦的时候才会出现，在咨询过程中，来访者想要获得提升，势必会体验到很多不快乐。
在确定了咨询目标之后，就需要商定咨询方案了。首先需要对咨询进行阶段的大致划分：建立咨询关系、收集资料、澄清问题、确立目标、制定方案、实施行动、检查反馈和结束巩固。根据咨询时长，一般会把咨询阶段分为三个阶段，第一个是诊断阶段，通过摄入性谈话、观察了解、心理测验等来收集求助者的相关信息，明确求助者的问题、产生问题的原因、问题的严重程度等，最终做出明确的心理诊断。第二个是咨询阶段，这是心理咨询中最为重要的实质性阶段，来访者发生改变往往就在这个阶段。第三个是巩固阶段，在每一次咨询的结束或是最终咨询的结束，都需要对咨询进行总结巩固，使来访者可以将咨询中获得的成长运用到今后的生活中。
咨询方案应该包括七个方面的内容：咨询目标、咨询的具体心理学方法或技术原理和过程、咨询的效果及评价手段、双方各自特定的责任、权利与义务、咨询次数与时长安排、咨询的相关费用以及其他问题的有关说明。